蓝景科信DAP-seq（DNA亲和纯化测序）技术服务

DAP-seq实验原理是基于DNA亲和纯化，通过体外表达转录因子鉴定TFBS的技术，具有不受抗体和物种限制，且高通量的优势，自该技术问世以来，已被广泛应用于转录调控和表观组学的研究。能帮助您快速找到转录因子的结合位点，寻找转录因子调控的靶基因。

DAP-seq实验原理

在功能基因组学和表观遗传学研究中，转录因子结合位点（TFBS）的发掘一直是研究热点。传统的ChIP-seq（染色质免疫共沉淀测序）方法，在抗体质量很好的情况下能够有效检测到TFBS。然而，好的抗体可遇不可求，这限制了ChIP-seq更广泛的应用。

DAP-seq技术的出现，使TFBS 的研究不再局限于物种，不再受抗体质量的限制，为生命科学领域转录因子的研究提供了新的有效工具。

DAP-seq具有与ChIP-seq同样的功能。通过体外蛋白表达技术，表达出带有标签的转录因子，和基因组DNA文库在体外进行结合，然后分离出所有与转录因子结合的DNA，再使用高通量测序，找到转录因子的结合位点。

蓝景科信为您提供DAP-seq全流程技术服务和个性化数据分析，具有100多个物种，1000多个转录因子的实战经验。欢迎咨询。

客户发表文章：

2023年2月9日，浙江大学农业与生物技术学院的最新研究成果，发表在Molecular Plant期刊上(IF=21.949)，文章题目为“Single-cell transcriptomic analysis reveals the developmental trajectory and transcriptional regulatory networks of pigment glands in Gossypium bickii”。该研究使用DNA亲和纯化测序(DAP-seq)技术鉴定了比克氏棉子叶GoPGF的结合基序和下游靶基因。并进一步揭示了比克氏棉色素腺形态建成的调控网络，为培育具有特定性状的栽培棉花新品种提供了宝贵的基因资源。  

   2023年1月31日，西北农林科技大学园艺学院苹果重点实验室的最新研究成果，发表在Plant Physiology期刊上(IF=8.005)，文章题目为“MdERF114 enhances the resistance of apple roots to Fusarium solani by regulating the transcription of MdPRX63”。该研究使用DNA亲和纯化测序(DAP-seq)技术鉴定了苹果MdERF114的结合基序和靶基因。进一步研究揭示了MdERF114正向调控苹果根系抵御腐皮镰刀菌侵染的分子机制，为培育抗ADR的砧木提供了宝贵的基因资源。

     2023年01月03日，中南林业科技大学的最新研究成果，发表在Communications Biology 期刊上(IF=6.548)，文章题目为“The bHLH-zip transcription factor SREBP regulates triterpenoid and lipid metabolisms in the medicinal fungus Ganoderma lingzhi”。该研究使用DNA亲和纯化测序(DAP-seq)技术鉴定了药用真菌灵芝中bHLH-zip转录因子SREBP的结合基序和靶基因。进一步研究揭示了SREBP调控灵芝中三萜类化合物和脂质代谢的分子机制，为提高灵芝物种的GA产量提供了宝贵的基因资源。

     2022年12月21日，中国农业科学院棉花研究所的研究成果发表在Plant Physiology期刊上(IF=8.005)，文章题目为“A brassinosteroid transcriptional regulatory network participates in regulating fiber elongation in cotton”。该研究使用DNA亲和纯化测序(DAP-seq)技术鉴定了陆地棉中BR信号通路核心转录因子GhBES1.4的结合基序和靶基因。揭示了GhBES1.4介导的BR调控棉纤维伸长的网络，为培育陆地棉优质纤维新品种提供了宝贵的基因资源。

       2022年10月，浙江大学农业与生物技术学院宋凤鸣课题组的最新研究成果，发表在学术期刊Journal of Integrative Plant Biology（IF=9.106）上，文章题目为“The NAC transcription factor ONAC083 negatively regulates rice immunity against Magnaporthe oryzae by directly activating transcription of the RING-H2 gene OsRFPH2-6”。该研究使用DNA亲和纯化测序(DAP-seq) 技术鉴定了水稻中转录因子ONAC083的结合基序和靶基因。进一步研究揭示了OsNAC083通过结合ACGCAA元件影响OsRFPH2-6转录，进而负调控水稻对稻瘟病的抗性。

     2022年9月，中国热带农业科学院热带生物技术研究所功能基因研究组在Plant Biotechnology Journal（IF=13.263）在线发表了题为 “A CC-type glutaredoxin, MeGRXC3, associates with catalases and negatively regulates drought tolerance in cassava (Manihot esculenta Crantz)” 的研究论文，证实了CC类谷氧还蛋白MeGRXC3可以在转录和转录后水平调控过氧化氢酶的活性、影响过氧化氢在叶片表皮不同类型细胞中的分布，从而调控木薯对干旱胁迫的响应。

        2022年8月，广西大学农学院甘蔗生物学重点实验室/亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室张木清/姚伟研究团队在Journal of Experimental Botany（IF=7.298）在线发表了题为“ScAIL1 modulates plant defense responses by targeting DELLA and regulating GA and JA signaling”的研究论文，该研究发现了一个甘蔗新的AP2家族转录因子ScAIL1，通过靶向DELLA调节JA与GA合成，平衡植物生长与防御。

     2022年8月，安徽农业大学、中国水稻研究所和上海市农业科学院作物育种栽培研究所在The Plant Journal（IF=5.726）期刊联合发表了题为“OsSGT1 promotes melatonin-ameliorated seed tolerance to chromium stress by affecting the OsABI5-OsAPX1 transcriptional module in rice”的文章，揭示了OsSGT1和ABI5相互作用，调控OsAPX1的表达，促进褪黑素改善种子在铬污染条件下萌发的分子机制。

       2022年8月，扬州大学生物科学与技术学院、植物功能基因组学教育部重点实验室高勇课题组在The Plant Cell（IF=12.085）上在线发表了题为“Phytochrome Interacting Factor Regulates Stomatal Aperture by Coordinating Red Light and Abscisic Acid”的研究论文，揭示了光敏色素互作因子（phytochrome interacting factors, PIFs）通过协调红光和脱落酸（ABA）信号调节气孔开度的分子机制。

       2022年7月，北京市农林科学院玉米DNA指纹及分子育种北京市重点实验室、齐鲁师范大学玉米分子育种研究院的共同研究成果，在国际学术期刊Theoretical and Applied Genetics(IF=5.574)上发表，题目为“ A newly characterized allele of ZmR1 increases anthocyanin content in whole maize plant and the regulation mechanism of diferent ZmR1 alleles”。本文主要研究内容是鉴定了玉米花青素合成相关等位基因ZmR1CQ01，并揭示了3个ZmR1等位基因的生物学功能和分子调控机制。

       2022年5月，中科院植物所王雷研究组在Plant Physiology（IF=8.005）期刊上发表了题为“Rice CIRCADIAN CLOCK ASSOCIATED1 transcriptionally regulates ABA signaling to confer multiple abiotic stress tolerance”的研究成果。该研究揭示了OsCCA1调控水稻适应盐胁迫、干旱胁迫以及渗透胁迫的分子机制。其中，该研究使用了DNA亲和纯化测序技术（DAP-seq，DNA Affinity Purification Sequencing），鉴定了水稻生物钟核心组分OsCCA1（Oryza sativa CIRCADIAN CLOCK ASSOCIATED 1）调控的下游靶基因。

       2021年4月29日，重庆文理学院园林与生命科学学院陈泽雄教授的研究成果，发表在植物科学领域的学术期刊Plant Science（IF=5.363）上，文章题目为“A R2R3-MYB transcriptional activator LmMYB15 regulates chlorogenic acid biosynthesis and phenylpropanoid metabolism in Lonicera macranthoides”。该研究使用DNA亲和纯化测序(DAP-seq) 技术鉴定了金银花R2R3-MYB转录因子LmMYB15的DNA结合基序及其靶基因。进一步研究揭示了LmMYB15调控金银花CGA生物合成和苯丙素代谢的分子机制，该研究成果为利用基因工程策略开发富含CGA的金银花新品种提供了宝贵的基因资源。

       2020年4月，北京工商大学与蓝景科信合作，Biochemical and Biophysical Research Communications（IF=3.322）发表了题为“ Phytochrome-interacting factors regulate seedling growth through ABA signaling”的文章，为揭示PIFs转录因子调控ABA信号转导机制提供了重要线索。

       2019年9月，北京林业大学和蓝景科信合作，在植物学主流学术期刊Journal of Experimental Botany（IF=5.36）上，发表了题为“Populus euphratica WRKY1 binds the promoter of H+-ATPase gene to enhance gene expression and salt tolerance”的研究成果。该研究借助DNA亲和纯化测序（DNA Affinity Purification Sequencing，DAP-seq）技术，深入揭示了胡杨耐盐的分子机制。

相关服务：

1、 凝胶阻滞实验（EMSA）：DAP-seq后续验证服务。

2、 酵母单杂交：DAP-seq后续验证服务

3、 ChIP-seq：高效检测重组蛋白、转录因子在基因组的结合位点

4、 DAP-seq与RNA-seq联合分析： 分析转录因子的靶基因在RNA-seq数据中的表达变化，深入挖掘DAP-seq和RNA-seq测序数据，增加转录组测序的分析深度。

5、 DNA-pull down：鉴定与DNA结合的蛋白。

7、Halo Pull Down：检测已知蛋白质之间的相互作用，鉴定与已知蛋白相互作用的未知蛋白。

6、被子植物353个单拷贝核基因靶向捕获测序服务：为研究被子植物的系统进化和分类、植物适应性机制、种群进化历史、种群的结构、基因渗透和漂移提供高效的整体解决方案，且适用多种样本类型。