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根系表型分析系统是基于图像识别技术的根系表型分析系统,专业用于植物离体洗根后的根系分析,可以分析根系长度、直径、表面积、体积、根尖数、分叉数等,广泛适用于根系形态学及构造研究。可用于解决根系结构和几何参数难以获取的问题,提升从业人员工作效率、减少人工成本,提供根系表型多参数快速分析方法,服务于植物科学研究。
1.图片预处理功能
1.1二值化:在目标和背景比较相似时,调整阈值来凸显目标轮廓。
1.2杂质剔除:设定一个像素值后,软件自动剔除图片中小于该像素的独立点,以保证分析不受杂质影响,更为准确。
1.3自由选择目标区:分析根系的某一部分。
2.辅助测量功能
2.1放大缩小:放大缩小图片以便对根系局部进行观察和调整。
2.2自动标定:用户输入扫描像素后,软件自动换算实际长度。
3.保存图片、数据导出及追加
3.1保存图片、数据导出:将图片或数据导出至文件夹。
3.2数据追加:将该条数据追加至文件下方。
3.3直方图导出:根据分档参数不同,导出相应的直方图。
4.各个参数的自定义分档
长度、直径、投影面积、表面积、体积均可进行自定义分档,分档结果可导出。
5.大批量全自动分析:
打开多张图片后,自动进行分析,并显示分析进度,分析完成后自动导出至固定文件夹。
6.拓扑分析
选点后自动识别后用不同颜色标出主根及侧根、自动计算侧根数量。
7.还原至初始图片:
在图片进行分析或操作后,将图片还原为刚打开时的状态。
8.手工校正分析结果:
合并分叉、删除连接、合并根尖、断开连接、毛刺去除
1、系统整体参数:
(1)根尖数:总根尖数量,等于终止连接点的数量
范围:0-1,000
精度:误差<5%
(2)根系长度:总的根系长度,包括主根和各级次根
范围:0-10,000 mm
精度:误差<3.65%
(3)平均直径:根系的平均直径
范围:0-20 mm
精度:误差<0.04%
(4)投影面积:根系整体的投影面积
范围:0-200,000 mm2
精度:误差<4.02%
(5)表面积:整体的表面积
范围:0-1,000,000 mm2
精度:误差<3.75%
(6)体积:整体体积
范围:0-2,000,000,000 mm3
精度:误差<3.82%
2、系统拓扑分析参数(需要相对完整根系):
(1)数量:各级根的数量总和
范围:0-1,00
(2)连接数:各级侧根上的连接数总和
范围:0-100
(3)长度:各级侧根的长度总和
范围:0-10,000 mm
(4)直径:各级侧根的平均直径
范围:0-20 mm
(5)表面积:各级侧根的表面积总和
范围:0-1,000,000 mm2
(6)体积:各级侧根的体积总和
范围:0-2,000,000,000 mm3
(7)投影面积:各级侧根的投影面积总和
范围:0-200,000 mm2
关键词:植物根系分析系统、根系成像分析系统、根系表型测量系统