截至目前，葡萄牙、比利时、美国、荷兰、意大利、西班牙、法国等多国的研究团队发布猴痘病毒基因测序报告，根据测序报告和进化树对比，表明猴痘可能已经在欧洲发生了大规模的社区传播。
各国猴痘基因组测序情况汇总如下图：
| 报告时间 | 国家 | 测序平台 | 测序方法 | 平均测序深度 | 结果 |
5月19日 | 葡萄牙 | Oxford Nanopore MinION | NQ法宏基因组测序 | 7倍 | 基因进化树分析草案显示，分离出来的病毒与2018年和2019年从尼日利亚传播到英国、以色列和新加坡的病毒有密切关系 |
5月23日 | 葡萄牙 | Illumina | 高通量NQ法宏基因组测序法 | 201倍(平均) | 这次多国猴痘暴发很可能只有一个源头，迄今为止公布的所有BD基因序列都紧紧聚集在一个分支上(美国公布的病毒基因组序列(MPXV_USA_2022_MA001)相比较) |
| 5月19日 | 德国 | Illumina | 该菌株分类为西非分支，与最近来自欧洲和美国的菌株相关 | ||
5月20日 | 比利时 | Oxford Nanopore MinION | 非靶向宏基因组 | 18.9倍 | 比利时猴痘病毒基因组（ITM_MPX_1）也属于猴痘病毒的西非分支，与最近上传的葡萄牙疫情基因组关系最为密切 |
| 5月20日 | 美国 | Oxford Nanopore MinION | 仅仅公布猴痘患者所携带病毒的基因测序结果 | ||
5月26日 | 荷兰 | Oxford Nanopore MinION | 10倍 | 病毒在进化树上与此前葡萄牙团队公布的基因组样本极为相似，与关系最为密切的一份葡萄牙样本相比，只出现了2个单核苷酸多样性位点(SNP s) | |
5月27日 | 意大利 | Illumina | 19倍 | 获得的基因组属于MPXV的西非分支，与最近从葡萄牙疫情上传的基因组关系最为密切，这进一步证明了欧洲的大规模社区传播 | |
5月27日 | 西班牙 | Illumina | 77倍 | 该病毒基因组同属猴痘病毒西非进化支，与关系最密切的葡萄牙一支序列相比，单核苷酸多样性位点(SNPs)小于4个，与德国序列相比，单核苷酸多样性位点(SNPs)为2个 | |
5月28日 | 法国 | Illumina | 宏基因组下一代测序 | 950倍 | 相较于2018年在英国发现的猴痘病毒基因，这四份病毒基因样本出现了46个单核苷酸多态性位点((SNPs)和3个缺失 |
上述的测序结果都表明：本轮猴痘疫情爆发极有可能来自一个源头，都属于西非分支；同时，猴痘在欧洲已经出现大规模社区传播。
目前多个国家通过社交应用程序、社交媒体医疗服务机构等多种渠道提醒，大规模社区传播需引起警觉。
北京百奥创新科技有限公司提供基因测序服务，助力猴痘病毒基因组测序，欢迎咨询。
留言