由于高速离心机的转动惯性较大，其启动电流大，持续时间较长，故电气设备及线路应能承载较大的负荷，不要超过离心机铭牌或说明书中的转速和固体密度，在机器安装未牢固前，不允许操作离心机，启动前，应拧紧机盖压紧螺栓及皮带罩固定螺栓。
操作时，如有明显异常和振动，应立即停机检查，旋转部件如转鼓，螺旋推料器在维修时需要焊接，打磨时需与原生产厂家联系。
高速离心机进行固液分离的话，是通过螺旋交叉和合适速度，来进行和实现的，而这一种离心机用来处理蛋白污泥的话，其出料口出现堵料现象的离心机判断，是看离心机中电流是否过高，如果有的话，则说明存在该问题，要及时处理解决，不能拖延。
高速离心机操作安全防护的五个要点：
1、围场操作：围场操作是把感染性物质局限在一个尽可能小的空间(例如生物安全柜)内进行操作，使之不与人体直接接触，并与开放之空气隔离，避免人的暴露。实验室也是围场，是第二道防线，可起到“双重保护”作用。围场大小要适宜，以达到既保证安全又经济合理的目的。目前，进行围场操作的设施设备往往组合应用了机械、气幕、负压等多种防护原理。
2、屏障隔离：气溶胶一旦产生并突破围场，要靠各种屏障防止其扩散，因此也可以视为第二层围场。例如，生物安全实验室围护结构及其缓冲室或通道，能防止气溶胶进一步扩散，保护环境和公众健康。例如，BSL-3实验室核心区和半污染区之间的缓冲间则把操作感染性材料的核心区围场在尽可能小的范围内。按国家标准《实验室生物安全通用要求》(GBl9489-2004)的要求，进出核心实验室的缓冲间是必需的设置。
3、定向气流：对生物安全三级以上实验室的要求是保持定向气流。其要求包括：
1)实验室周围的空气应向实验室内流动?以杜绝污染空气向外扩散的可能，保证不危及公众；
2)在实验室内部，清洁区的空气应向操作区流动，保证没有逆流，以减少工作人员暴露的机会；
3)轻污染区的空气应向污染严重的区域流动。
4、有效消毒灭菌：实验室生物安全的各个环节都少不了消毒技术的应用，实验室的消毒主要包括空气、表面、仪器、废物、废水等的消毒灭菌。在应用中应注意根据生物因子的特性和消毒对象进行有针对性的选择。并应注意环境条件对消毒效果的影响。凡此种种，都应在操作规程中有详细规定。
5、有效拦截：是指生物安全实验室内的空气在排人大气之前，必须通过粒子空气(HEPA)过滤器过滤，将其中感染性颗粒阻拦在滤材上。这种方法简单、有效、经济实用。HEPA滤器的滤材是多层、网格交错排列的，因此其拦截感染性气溶胶颗粒。
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