在医疗、或制药等实验中都离不开离心机，其使用过程中对环境的要求很高，无论是非无菌环境还是无菌环境，比如在无菌车间，就有万级、十万级等车间，良好的密闭性能可使得外部与机器内部保持有效的隔离。内腔中的固、液、气相不能与操作员、外部产生污染。
如何做到不污染环境，制造商应对离心机的密闭性能进行改进设计，并在生产时充分体现，
机盖的密封：机盖因是可翻式，与壳接处面应有可靠的密封措施，若因密封配件防腐失效，就可能造成液、气相的泄漏，对环境、人员造成伤害。
轴承位的密封：对于主轴螺母、轴承位的密封，以前的传统机型在这方面的密封措施比较简易，如气相渗入，对主轴锥面产生腐蚀，甚至渗入轴承中，对轴承产生破坏，从而影响机器的正常使用。上轴承盖一般都设置骨架式密封等结构，但上轴承盖与转鼓锥孔之间的一部分则暴露在外，离心机内腔中的气相，则可能对主轴暴露面产生腐蚀。制药行业所用的离心机，其所分离的物料中大都有机溶剂或酸、碱、盐等介质，因此在订购设备时应充分考虑到这些部位的密封要求，
主要是从安全角度出发，以提高其使用安全性，但对于磨擦所产生的粉尘对环境的污染则没有加于控制，如在洁净区内使用是不可行的。因此，必须对传动带工作区域密闭起来，以防止磨擦粉尘的外泄。
其它部位；密封槽结构（出液管、进料管、出料斗等接口部位）：对于离心机的外接管道，一般情况下选用法兰安装方式，以确保其接口的密封性能，使得无菌车间环境更洁净。
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