Pheno Mapper:用于可视化探索表型数据的交互式工具箱
时间:2024-10-21 阅读:163

比较Hippo-X(HX)与Pheno Mapper的特征。蓝色表示“是”(Y),粉红色表示“不”(N)。
在本文中,作者介绍了Pheno-Mapper,一个用于探索性分析和可视化大规模现象数据的交互式工具箱。作者的方法是使用mapper框架对数据进行拓扑分析,然后使用内置的数据分析和机器学习功能呈现可视化表示。作者在真实的植物(如玉米)现象数据集上演示了这一新工具的实用性。

Pheno-Mapper 的用户界面
与现有方法相比,Pheno-Mapper的主要优势在于它提供了丰富的、交互式的对物候数据进行探索性分析的能力,并且它以一种易于扩展的方式将可视化分析与数据分析和机器学习相结合。特别是,Pheno-Mapper允许在数据拓扑总结的指导下进行子种群的交互选择,并将数据挖掘和机器学习应用于这些选定的子种群进行深入探索。
来源:Pheno-Mapper: An Interactive Toolbox for the Visual Explorationof Phenomics Data.
Youjia Zhou,Methun Kamruzzaman,Patrick Schnable,Bala Krishnamoorthy,Ananth Kalyanaraman,Bei Wang
https://arxiv.org/pdf/2106.13397.pdf