1)在离子色谱仪结构方面,离子色谱和液相色谱均有溶剂输送系统、进样系统、检测系统和信号记录和处理系统,但由于离子色谱和液相色谱所用的流动相不同,检测方式不同及信号处理的要求不同,在各部件上有一些差别。具体如下:

　　A、离子色谱一般采用酸、碱及盐的水溶液作为流动相,因此通常离子色谱采用非金属材料作为整个系统材料,一般采用Peek塑料作为泵体、流路和阀体等要求耐高压的部分,而聚四氟乙烯材料作为检测器,外接管路等,要求系统可以耐酸、耐碱,但一般情况下全塑的材料由于加工和强度方面的差异,耐压强度和精度上比金属材料要略低一些。而液相色谱由于一般采用有机溶剂作淋洗液,因此多数还是采用金属泵体,可以耐任何类型的有机溶剂,但对于酸或碱的溶剂,使用易产生腐蚀现象。而随着液相色谱在生物领域的广泛应用,金属对一些生物活性化合有一定的吸附作用,一些在生物方面应用液相色谱也广泛采用了Peek材料作为泵体、流路和阀,使离子色谱和液相色谱具有了一定的通用性。

　　B、前述已经提到离子色谱又分为抑制型和非抑制型,而目前被广泛应用抑制型离子色谱,采用了抑制器,而普通液相色谱没有类似装置。抑制器的结构上与液相色谱的柱后衍生系统相似,但是抑制型离子色谱*组件之一。非抑制型离子色谱不用抑制器,与液相色谱十分相似,一些非抑制型离子色谱基本上就是采用液相色谱的泵、流路和进样阀。

　　C、离子色谱与液相色谱另一差异就是检测器,一般情况下液相色谱采用紫外-可见光度检测器;而离子色谱zui通用的是电导检测器。

　　2)离子色谱与液相色谱另一差异在于分析对象,液相色谱作为分析仪器中zui广泛使用的一类仪器,在许多领域中被广泛应用,但一般情况下,采用液相色谱时,要求被测物具有一定光度吸收,因此液相色谱一般可以用于有机化合物的分析。而离子色谱主要利用离子在水溶液中电离产生电导的特点,因此离子色谱主要用于无机离子的分析。当然,离子色谱和液相色谱的应用并不是的,目前离子色谱已经广泛用于有机化合物的分析,而液相色谱也可以解决大量无机离子的分析,两种具有互补性。有大量液相色谱无法解决分析难题,可以尝试用离子色谱的方法解决。

　　从色谱原理上分类,离子色谱是液相色谱的一种,但由于离子色谱与普通液相色谱在结构和分析对象上有一些差异,一般作为均独立的一个色谱大类。离子色谱与液相色谱的差别主要从两个方面看,即仪器结构和应用范围。