本文所讨论的高效液相色谱仪，在结构上具有一定的复杂性，其在色谱仪运行和应用的过程中发挥着不同类型的作用。下面针对其仪器主要结构进行简要分析。
1.1储液器
储液器顾名思义，主要承担的是对待检测液体在检测时所使用的溶剂的储存。在检测器的运行过程中，常用以下几种溶剂进行检测应用，如检测食品中三氯蔗糖含量时使用的乙腈和水、检测防腐剂时使用的甲醇与乙酸铵等。这里要强调的是，若溶剂类型为有机类溶剂，则会对其纯度提出很高的要求。在应用前必须提前做好过滤和提纯工作。因为一旦溶剂内混有杂质或颗粒物，则会对检测仪器本身的运行造成阻碍，严重时还会损坏仪器。
1.2流动泵
流动泵是实现液体检测流程的关键，通过流动泵的推动作用，储液器中的溶剂液体才能够被推送至分离检测系统，并在送入系统后以正常的流动速度和状态在系统内运转，对于高效的液相色谱仪来讲，其运行中允许产生的流量波动比率一般不得高于3%。另外，不正常的运行状态通常包括压力高于标准水平和低于标准水平两种类型。过高的压力一般是由于色谱柱的污染导致，而压力过低主要由泄漏问题造成。
1.3进样器和色谱柱
进样器是样品经过检测前停留的主要场所，从其结构性质上分类，可分为手动和自动两种进样器类型。其应用过程中比较典型的问题是样品液体因使用后处理不当而发生交叉污染。目前自动进样器在液相色谱仪中已普遍配备应用，其进样量控制更加准确，灵活执行进样程序，大大提高了检测效率。同时，自动进样器配备的洗针功能有利于减低样品的残留，进一步减小样品的交叉污染。