微生物往往被视为“无处不在，无所不为”的生物，制作重组基因的载体和表达重组基因的受体也需要微生物。20世纪90年代后期开始了微生物基因组的研究。这项研究是从对微生物完整的全基因核苷酸测序入手，在分析基因结构的基础上，认识微生物的完整生物学功能。 微生物基因组研究具有目标明确、相对投入少、收效快、成果易于转化为产品等许多优点。目前大多数微生物基因组已被国外学者报道，或正在测序，但还有一些我国*的微生物资源，如投入力量进行基因组研究，有可能很快获得高起点的基地。

微生物是一群形体微小、肉眼看不见的生物，必须经放大上千倍甚至数万倍才能观察到。在微生物诸多特性中，zui令人惊叹的是它们具有极其多样化的生理功能，可以在各种环境中生存：不仅在人或动植物体内生存，还可在空气稀薄的高空、高压力的深海底和温度高达90℃或－80℃的环境下生存，在矿井、油田、农田，甚至沙漠中都有微生物的存在。因此微生物往往被视为“无处不在，无所不为”的生物。

目前一般将微生物分为真菌、放线菌、细菌、螺旋体、立克次体、衣原体、支原体和病毒。但随着不断发现新的微生物，种类还在不断增多。病毒的种类（如流感病毒、肝炎病毒）在引起人类传染病的各种病原体中占75%。放线菌是产生抗生素和微生物药物的主要来源。细菌所致的严重人畜疾病仍占十分重要的地位，据世界卫生组织预测，如无有效的防治措施，10年内将有3000万人因结核病死亡，3亿人受结核菌感染。在过去的20年中，又发现30多种新病原微生物，比如新近发现幽门螺杆菌是引起胃溃疡的病因，从而*改变了溃疡病的治疗原则。蛋白质传染粒子（Prion）引起的人类克－雅病（Creutzfeldt?Jakob）和疯牛病将微生物致病病因覆盖的领域更进一步拓宽。在人类向外星球扩展的过程中，微生物这一生命活动方式极其多样化的特殊生物群体，将在科技的理论研究和开发应用中占有十分重要的地位。

天然存在于肠道中的病毒，像居住在肠道中、构成“微生物组”（microbiome）的细菌一样发挥了维持健康以及对抗感染的作用。

在历时两年完成的一系列小鼠试验中，该研究小组发现感染常见小鼠诺如病毒(murine norovirus,MNV)可帮助小鼠修复炎症造成的肠组织损伤，在抗生素治疗消灭微生物组后帮助恢复肠道的免疫防御。

 “我们的研究提供了令人信服的数据，表明小鼠肠道中病毒和细菌之间的相互支持关系，并为进一步研究病毒组支持免疫系统的确切机制奠定了基础，这有可能也适用于人类，”研究人员说。 “很久以前我们就知道人们老是感染病毒和细菌，并且他们不会生病。现在我们获得了科学证据证实，正如我们知道许多的细菌感染对于维持健康有益，并非所有的病毒感染都是不好的，实际上有可能有益于健康。”

根据研究人员所说，直到现在研究人员们还主要是追踪病毒组存在的遗传证据，但却没有人确认它正常存在于肠道中，或是阐明其扮演的是有害、中立或有利的角色。

在他们的研究中，该研究小组借助了以往对于培育形成炎性肠病的小鼠的研究。人们认为炎性肠病是一种受到微生物组细菌影响的疾病。该研究表明，在这些易感小鼠中慢性MNV感染可以对肠组织造成与慢性细菌暴露一样的炎症损伤，表明了一种相似的、免疫触发作用。

在新研究中，Cadwell和同事们培育出了没有正常肠道细菌，且由于缺乏细菌刺激和营养物免疫系统和肠均发育不全的小鼠，然后喂给这些小鼠MNV。相比于正常小鼠，这些小鼠缺乏免疫系统T细胞和B细胞，吸收营养物质的肠绒毛萎缩、更细，在绒毛之间的隐窝中有一些小于正常的周围组织。

在MNV感染两周后，与其他病菌严格隔离的这些小鼠显示免疫系统*恢复，几乎*逆转了肠损伤。

而在近期抗生素治疗消灭了肠道微生物组的正常小鼠中，给予MNV同样让它们恢复了健康。它们血液中的T细胞水平增加了一倍，在肠组织和血液样本中均可检测到B细胞抗体。

另外的一些测试证实，MNV介导的治疗效应依赖于增强抗病毒1型干扰素蛋白传递的免疫系统信号，证实了这种病毒在驱动免疫反应中发挥关键作用。