（１）一体化电磁流量计的应用有一定局限性，它只能测量导电介质的液体流量，不能测量非导电
介质的流量，例如气体和水处理较好的供热用水。另外在高温条件下其衬里需考虑。
  （２）一体化电磁流量计是通过测量导电液体的速度确定工作状态下的体积流量。按照计量要求，
对于液态介质，应测量质量流量，测量介质流量应涉及到流体的密度，不同流体介质具有不同的密度，而且随温度变化。如果一体化电磁流量计转换器不考虑流体密度，仅给出常温状态下的体积流量是不合适的。
 （３）一体化电磁流量计的安装与调试比其它流量计复杂，且要求更严格。变送器和转换器必须配套使用，两者之间不能用两种不同型号的仪表配用。在安装变送器时，从安装地点的选择到具体的安装调试，必须严格按照产品说明书要求进行。安装地点不能有振动，不能有强磁场。在安装时必须使变送器和管道有良好的接触及良好的接地。变送器的电位与被测流体等电位。在使用时，必须排尽测量管中存留的气体，否则会造成较大的测量误差。
 （４）一体化电磁流量计用来测量带有污垢的粘性液体时，粘性物或沉淀物附着在测量管内壁或电极上，使变送器输出电势变化，带来测量误差，电极上污垢物达到一定厚度，可能导致仪表无法测量。
 （５）供水管道结垢或磨损改变内径尺寸，将影响原定的流量值，造成测量误差。如100ｍｍ口径仪表内径变化1ｍｍ会带来约2％附加误差。
 （６）变送器的测量信号为很小的毫伏级电势信号，除流量信号外，还夹杂一些与流量无关的信号，
如同相电压、正交电压及共模电压等。
   为了准确测量流量，必须消除各种干扰信号，有效放大流量信号。应该提高流量转换器的性能，采用微处理机型的转换器，用它来控制励磁电压，按被测流体性质选择励磁方式和频率，可以排除同相干扰和正交干扰。但改进的仪表结构复杂，成本较高。