紫外线消毒器杀菌消毒是一道使大量水生病原体灭活的有效屏障。在多屏障消毒工艺中，紫外线消毒可作为杀灭特殊病原体（如隐孢子虫和贾第鞭毛虫）的有效屏障，并有助于尽量降低消毒副产物。紫外线消毒器可以应用于饮用水水源的消毒，包括过滤后的地表水、未经过滤的地表水和地下水。对于过滤后的地表水，紫外线消毒的前处理工艺包括颗粒或合成介质过滤、膜过滤（微滤、超滤、纳滤和反渗透）、硅藻土过滤或慢砂滤。紫外线消毒器也可用于污水消毒杀菌，污水紫外线消毒器分为管道式紫外线消毒器和渠道式污水紫外线消毒器，管道式污水紫外线消毒器采用压力管道形制，渠道式污水紫外线消毒器也叫明渠式紫外线消毒器或框架式紫外线消毒器。

紫外线消毒器杀菌拥有光谱杀菌能力，能够轻易的*杀死包括：军团菌属（Legionella）、阿米巴（amoeba）在内的130多种的有害菌、微生以及所有种类的真菌、滤过性病毒、霉菌、刨子。

尤为显著的是，在客观条件比较艰苦的广大农村地区，紫外线消毒器杀菌消毒不需要任何特殊的专业设备，只需把紫外线消毒器安装到供水管网中，通过紫外光照射流水就可以*消除饮水中的有害细菌，微生物，并且对水的味道，气味没有改变，从而使受处理的水达到饮用标准。饮用水紫外线消毒器这种简单、安全、实用性强、低投入的净水方法是非常适用于我国的农村地区，饮用水紫外线消毒器能解决农村饮用水卫生安全问题的。    

2007年夏天以来，我国的一些大中城市由于长期忽视环境保护，以及气候原因，造成了其饮用水水源大面积爆发蓝藻，其影响之大，不言而喻。

在经过环保部门的仔细评估后，针对目前的情况提出了饮用水紫外线消毒器杀菌消毒的方案来快速，有效的在短期内解决所面临的问题：

1安装饮用水紫外线消毒器，可以达到以下功效：

1）消除自来水的异味

2）消除所有的有害细菌

2如果水源不是活水，是水库，蓄水池等，紫外线消毒器也能起到杀菌消毒效果。

紫外线消毒器杀菌消毒技术对近些年发现的致病性病原微生物贾第虫和隐孢子虫具有良好的灭活效果。隐孢子虫孢囊通过人畜的粪便排入环境，它们可在环境中存活很长时间，隐孢子虫卵囊和贾孢子虫孢囊比其它水传染病源微生物的存活时间长，因而可引起多次疾病的爆发。隐孢子虫引起的疾病非常严重，其普遍的的症状是腹泻、呕吐、低烧，类似流感的症状，而对免疫机能不健全的患者，如艾滋病患者，其疾病更为严重，导致死亡。如1994年美国拉斯维加斯市爆发隐孢子虫病，20名艾滋病患者死亡。近年来的研究表明，使用低压汞灯和中压汞灯的辐射剂量在30J/m²时，能灭活隐孢子虫99.9 %以上，并且通过大量的实验证明低压汞灯紫外线消毒器和中压汞灯紫外线消毒器均能有效地灭活隐孢子虫。