二氧化氯对微生物的灭活效果随其投加量的增高而进步，消毒剂对微生物的总体灭活效果取决于残余消毒剂浓度与接触时间的乘积，因此延长接触时间也有助于进步消毒剂的灭菌效果，但出水余量不可过高，否则易产生异味和进步色度。
   二氧化氯投加需留意的其它事项：因二氧化氯具有遇光分解的特性，假如沉淀池滤池的采光前提较好，应在投加二氧化氯时在沉淀池和滤池增加避光举措措施，否则将会泛起以下情况：1.二氧化氯遇光分解，使二氧化氯不能充施展作用，并分解产生亚氯酸盐、氯酸盐。   2. 在反应池和沉淀池的过渡段、滤池（恒水位工作）滞水区存在藻、蚤的二次繁殖题目。（二氧氯因自身分解及遇光分解，滞水区二氧氯浓度很低，藻、蚤类具有趋光性，为二次繁殖提供有利前提。）（夏季在斜板和滤池排水槽及池壁生长苔藓虫群落，主要原因也是光。）
   二氧化氯发生器对微生物的灭活机理：提高前辈入微生物体内，然后破坏微生物体内的酶和蛋白质以达到灭活微生物的目的，但二氧化氯对细胞壁有较强的吸附和穿透能力，特别是在低浓度时更加凸起。二氧化氯主要通过两种机理灭活微生物，
1、是二氧化氯与微生物体内的生物分子反应。
2、是二氧化氯影响微生物的生理功能。