任务承接
任务承接是监测业务流程的入口，该项功能需按照监测类别分为三大类进行设计：
（1）指令性计划任务
（2）政府非计划性任务
（3）社会委托类任务。
（4）应急监测类任务，建设应急监测类数据库。

任务启动后提交项目负责人进行监测方案编制，应急监测除外。
监测方案编制及审核
利用GIS系统确定监测方案所需包含要监测企业的污染源信息，采样点信息等，可对采样周期，频次以及每次采样个数，每个样品监测分析项目，每个监测点应用的评价依据进行定义。可根据要监测的采样点个数、监测项目的采样和分析费用，初步计算出监测费用。
支持附件功能，可以将现场踏勘的材料上传，包括照片、地图截图、监测点位设定等。
在该环节可进行采样任务管理，可以根据需要管理采样任务，并设定采样任务负责人，制定采样计划，并可以设定采样任务重新采样。
该环节采用工作流审核，支持方案制订、流转、审核、批注、退回等功能。同时具备监测数据管理功能，包括监测任务数据、采样任务数据的管理等。
1. 合同编制和评审
监测方案获得批准并客户同意后，需签订监测合同或协议（部分小型项目监测内容比较简单，监测方案和监测协议内容统一在一起）。系统自动生成固定格式的合同文本或技术协议。
2. 缴费确认
客户按照合同付款条件向财务部门付费，系统能够记录统计付费的金额和收据信息。付费的情况根据不同任务有所不同，综合系统应支持一次性预付、分批支付或监测报告完成后支付等多种付费方式，能够对快到期或延期未付款项进行提醒。
3. 任务下达
通过审批的任务，综合系统可自动生成任务通知单，相关部门对已缴费或不需要提前交费的任务进行任务签发。签发后，意味着该任务正式被受理，系统自动根据任务的开始时间进行工作完成时限的考核和提醒。
4. 任务管理
在此可以对所有下达的任务进行状态跟踪，可以查询任务的具体信息，对即将到期任务进行提醒，实现任务的完成情况统计。
当监测任务不符合监测条件时，可拒绝或终止任务。
5采样信息录入
1. 样品交接
2. 分样及添加质控样
3. 样品分析
4. 数据复核及审核
系统应具有数据复核及审核功能，可以按照分析项目或整个项目的所有样品进行复核及审核。实现超标项目分颜色闪烁等。
6. 质控审核
7. 留样管理
6.报告编制审核
监测任务完成后，可以输出监测报告，报告编制不仅指的是对报告内容的编辑，同时也可以进行对报告格式的编制，能自动形成各种监测类型的报表，可形成日报、月报、季报和年报等。报告可以输出到WORD、EXCEL，也可以打印输出。报告的审批流转基于工作流，可以由用户定义流程。支持在移动设备上进行报告审批。
1、报告制作
2、报告审核
用户根据权限对报告进行审核，审核时能够浏览报告，查询监测过程各项原始记录表，查看样品的明细数据，可以标注审核意见，但是不能修改报告。如果认为不符合可以退回，并记录退回原因，将已经标记要修改的内容的报告以附件的形式，退回给报告编制人员。
3、报告签发
系统支持根据监测项目类型不同不同的报告签发人，并可以使用电子签名，签发报告过程中可以查看任务书、现场采样记录、样品交接记录、分析原始记录等相关内容。报告签发界面应有多页面同时显示功能，方便查阅相应的方案、环评报告等内容。如果认为不符合可以拒签，并记录拒签原因，还可把拒签的已经标记要修改的内容的报告以附件的形式，退回给报告编制人员。
4、报告分发
报告签发后，可以打印、盖章并按照规定的方式分发。
5、报告的归档及管理
对于各类监测报告和各种监测记录，可按照环保档案管理标准要求进行归档，所产生的电子档案应便于计量认证和实验室认可评审时快速浏览和查询。
对报告的详细情况进行管理，包括报告的客户、编号、发放人、发放时间、取报告人、并可以关联到相关的分析数据和审核数据。
6、监测报告条形码防伪
使用二维条形码标识监测报告。生成报告时候一并将企业信息、超标信息等写进条形码，其他部门通过条形码就能快速得知该份监测报告的超标信息，亦可以通过系统调出监测报告详细情况，防止企业修改监测报告。