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DAP-seq助力揭示OsbZIP10-OsGIF1分子模块调控稻米品质的作用机制

时间:2024-07-19      阅读:775

水稻是世界重要的粮食作物,全球约有三分之一的人口以水稻为主食。随着人口的增长和饮食结构的改变,在对水稻产量的需求不断增加的同时,对稻米品质的追求也在不断提高。稻米品质包括食味品质、外观品质和营养品质等多个方面,其中,直链淀粉含量是影响食味品质的重要因素之一。然而,稻米的食味和外观品质的调控机制复杂,至今只阐明了一部分。

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202479日,上海市农科院、安徽农业大学、浙江大学海南研究院等多家单位联合在The Plant Journal(影响因子6.2)发表了题为“Transcription factor OsbZlP10 modulates rice grain quality by regulating OsGIF1的研究论文。该研究借助DAP-seq揭示了OsbZIP10-OsGIF1分子模块调控稻米品质的作用机制,为水稻精准设计育种提供了新的思路

该研究发现一个bZIP家族转录因子OsbZIP10可以激活转录水稻籽粒发育的关键基因OsGIF1。利用基因编辑、过表达和遗传杂交等方法,通过对不同遗传背景下的水稻品种进行表型分析,揭示了OsbZIP10对稻米品质的影响。OsbZIP10基因敲除的水稻品种在不同的遗传背景下均表现出较高的垩白率,但直链淀粉含量较低。这一结果表明,OsbZIP10对稻米的食味品质和外观品质均有着重要的影响(图1)。

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1OsbZIP10影响水稻的籽粒品质

通过DAP-seqRNA-seq联合分析发现,除了OsGIF1之外,OsbZIP10还调控了多个与灌浆过程相关的基因,包括编码ADP-Glc焦磷酸化酶(AGPase)小亚基的OsAGPS1基因(图2),以及参与活性氧(ROS)稳态调节的基因(图3)。

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图2:OsbZIP10直接调控OsAGPS1OsGIF1


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3OsbZIP10在籽粒形成过程中促进氧化还原稳态

此外,研究还发现OsbZIP10基因在粳稻和籼稻之间存在显著的遗传差异,大部分粳稻和籼稻品种属于两个不同的单倍型,这两个单倍型与籽粒直链淀粉含量密切相关。在低直链淀粉含量的遗传背景下,过表达与高直链淀粉含量相关的单倍型可以显著增加直链淀粉含量。

该研究揭示了OsbZIP10-OsGIF1分子模块在稻米品质调控中的重要作用,成果不仅为稻米品质调控提供了新的基因资源和分子网络,也为稻米品质改良和设计育种提供了新的理论依据和实践基础(图4)。


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4OsbZIP10-OsGIF1分子模块调控稻米品质的作用机制

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