LCMS-IT-TOF名称的由来是依据岛津的单级四极杆液质联用仪LCMS-2010的名称而来。LCMS代表液质联用，LCMS-IT-TOF的前端和LCMS-2010结构类似，后面增加了岛津的离子阱飞行时间质谱，因此命名为LCMS-IT-TOF。LCMS-IT-TOF可以广泛应用在有机小分子的结构分析，中药成分鉴定，食品，香料，农残兽残，药物代谢物鉴定，生物大分子的蛋白质组研究，包括多肽的一级从头测序，蛋白质鉴定，转录后修饰，复杂糖蛋白的分析等，其中未知化合物分子式预测是其特色的功能。通过对未知化合物的多级高质量精度碎片的解析，可以迅速判断该化合物的元素，化学式，从而得到该化合物的基本信息。因此LCMS-IT-TOF是功能全面的，高分辨高质量精度，同时具有多级质谱功能的高效液相－离子阱－飞行时间质谱。