根是作物的生命来源，植物通过根系从土壤中摄取养分、水分、有机质供茎、叶、果实生长。从一定程度上来看，根系的分布情况会直接反映作物的生长情况。为了进一步研究根系的影响，专家们通常都会利用植物根系图像分析系统对其进行研究，以判断当前作物生长状况，为制定科学施肥方案提供依据。
根系图像分析系统和传统仪器测定不同，系统不仅能测量根系的长度、面积、直径、根尖数、分叉数、根交叉数等基础信息，甚至还能自动分析出根系的拓扑形态关系、连接关系，和根尖部位的色彩变化，这些详细的测量数据能为农业生产带来更好的效果。
比如怎样加强根系吸水强度、提高根系水分传导能力为发展可持续农业、解决水资源供需矛盾提供科学依据是当前和未来实现节水农业的基础。分析植物根系的分布状况，可明确土壤水分。养分状况对植物根系水分、养分传导的影响，掌握植物根系吸收水分、养分特性从而为不同类型的农田、草地林地等选择较佳的灌水时期和灌水方式、提高植物根系水分利用效率提供依据。
通过植物根系图像分析系统还能研究深耕深松后的土壤结构对作物根系活性的影响。深耕深松技术能够加深耕层疏松土壤，增加土壤的孔隙度，促进作物根系生长，形成土壤水库，增强雨水渗入速度和数量避免产生地面径流，通气性强，提高作物根系呼吸作用使根系生长数量多。
